首都医科大学燕京医学院红十字会成立于2004年5月8日,下设办公室、组织部、培训部、宣传部、外联部、文娱部、社盟部、青协部、手语部、红丝带等10个部门。各部门根据需要招收部分干事，开展活动：办公室主要负责新闻、稿件、信息、通讯文档的管理工作；组织部主要负责规划开发各项志愿服务活动及组织协调工作；宣传部主要负责红十字会的日常宣传活动；外联部主要负责对外联系，并协同红会其他部门开展活动；青协部全称“青年志愿者协会”，主要负责组织和指导全学院青年志愿者服务活动；文娱部主要负责组织邀请学生参加学院各种晚会及活动演出，活跃学院的文化氛围；社盟部主要负责学院各大晚会、活动节目的外请部分的沟通、联系及学院与其他兄弟学院的交流联谊；手语部定期开展手语课程；青春红丝带社团主要负责艾滋病方面知识的宣讲，并组织与之相关的志愿者活动。