首都医科大学燕京医学院团委是在学院党委和上级团组织的领导下，围绕学院党团中心工作，以服务青年成长成才为目标，团结和带领广大青年团员开展丰富多彩的文娱体育活动，寓教育于文化之中，并有效联合学生组织，致力于开创青年工作新局面的学生群众性组织。团委由学生工作专职教师担任团委书记，负责全面引导学院团委工作；团委副书记由学生担任，协助团委书记处理日常事务，带领团委各部干事，加强各部建设。团委下设学生会和红会两大学生组织，发挥学院与学生之间的桥梁纽带作用；关注学生思想动态，关心学院广大学生的学习和生活，切实为学生服务。